blast | diamond 輸出結果選擇和解析 | 比對
之前的文章：構建NCBI本地BLAST數據庫 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast構建索引 | makeblastdb 本地運行blast時，需要指定out format。 常見的網頁版blast結果可以參照：Blast結果的詳細解析 ...
原文：blast及其格式輸出簡介
blast產生背景 雙序列比對可以采用是基於動態規划算法的Needleman Wunsch NW 和Smith Waterman algorithm SW 算法，雖然精度高，但計算消耗大。當與數據庫比對的時候，該算法就顯得不切實際。因此TASTA，blast采用啟發式算法使得通過大幅度丟失靈敏度來減少運行時間。與FASTA軟件相比，blast通過把搜索限制在狹隘的矩陣對角線條帶上，來改進FAST ...
2018-08-21 11:54 0 1501 推薦指數：
相關推薦
Matplotlib簡介和pyplot的簡單使用——輸出eps格式圖像
最開始使用Matplotlib，一是因為它不需要像Matlab一樣花很長時間啟動一個圖形界面，二是它可以直接保存為.eps格式。在圖像顯示出來之后，在左下角有幾個按鈕，最后一個就是保存，在保存的對話框選擇.eps格式即可。另一種方式就是在程序里面使用pyplot.savefig(name ...
C++輸入輸出流 cin/cout 及格式化輸出簡介
C++ 可通過流的概念進行程序與外界環境( 用戶、文件等 )之間的交互。流是一種將數據自源( source )推送至目的地( destination )的管道。在 C++ 中，與標准輸入/輸出相關的流可通過頭文件 <iostream> 使用，與文件讀寫相關的流可以通過頭文件 < ...
blast原理
blast的原理就是將想要明確注釋的sequence（這個sequence就是query）先打斷，即一條sequence變成多條sub-sequence（sub-sequence也就是word），然后拿這些sub-sequence與數據庫中的序列比較（數據庫中的序列是已經注釋 ...
Hex格式和Mot格式簡介
Hex格式和Mot格式簡介 一、Hex格式介紹 1.1 什么是 Intel HEX 文件格式？ Intel HEX文件 是由一行行符合 Intel HEX文件格式的文本所構成的ASCII文本文件。 在Intel ...
YAML文件格式簡介
一、yaml簡介 yaml是一種用來寫配置文件的序列化語言，跟json有些像，yaml又稱作json的超集，yaml的設計則是為了友好可讀性，主要用於配置信息的書寫，而json設計的目的則是為了簡單和通用，主要用於存儲數據和應用層數據通信使用。 二、格式 yaml主要有三種類型的數據 ...
OBJ文件格式簡介
Cube.obj mtllib cube.mtl g default v -0.500000 -0.500000 0.500000 v 0.500000 -0.500000 0.500000 v - ...
.yaml 文件格式簡介
數據結構、各種設定檔、傾印除錯內容、文件大綱（例如：許多電子郵件標題格式和YAML非常接近）。 盡管它 ...