超短reads（primer、barcode、UMI、index等）比對方法
二代reads最短都有50bp，所以大家常用的比對工具都是不支持50bp以下的reads的比對的。 但是，在實際中，我們確實又有比對super short reads的需求。 So，我找到了如下方 ...
原文：barcode(index)
在很多情況下，我們需要把多個樣本混合在一起，在同一個通道 lane 里完成測序。像轉錄組測序 miRNA測序 lncRNA測序 ChIP測序等等，通常每個樣本所需要的數據量都比較少，遠少於HiSeq一個通道的產出能力，混合樣本是普遍作法。以轉錄組測序為例，一個樣本測序 M片段 reads ，就能夠滿足絕大部分研究所需。而HiSeq 的一條通道，使用v 試劑，數據產出 gt M片段 如果雙端分別計算 ...
2018-03-20 11:46 0 1172 推薦指數：
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