利用python腳本,提取指定ID名稱的序列 ...
提取fasta文件genome_test.fa中第14號染色體的序列,其內容如下: >chr1 ATATATATAT >chr2 ATATATATATCGCGCGCGCG >chr3 ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT >chr4 ...
Some time when you want to change the fasta seq into one line For awk: awk '/^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^> ...
1、測試數據 2、 awk + sed實現 3、利用正則表達式及sed預存儲還原 ...
同樣的名為read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如: > ...
該軟件對於處理FASTA/Q十分方便,省去自己編寫腳本 安裝 使用 序列操作(seq) Fasta/q之間以及與tab格式互換 序列信息統計 ...
該軟件功能強大,兼容所有系統。 網站:http://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/ 下載,解壓,安裝seqkit軟件,下載二進制文件較好。 一、序列操作: 1.取反向序列 seqkit seq test.fa -r > ...