生信軟件工具-trim_galore
trim_galore 注意：軟件工具一般會定期進行迭代更新，如果使用出現問題，請查看官方文檔。 網址：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ 需先安裝fastqc ...
原文：使用trim_galore軟件遇到的問題
我的原始測序數據是雙端測序，在用trim galore軟件去接頭的這一步，使用的命令行是 相當然的以為軟件會默認為雙端測序，結果接下來一步用tophat軟件mapping到參考基因組上的時候，發現mapping率只用 ，低的驚人。后來排除建庫失敗的可能，我去查看了trim galore運行時的日志文件，如下： 發現是single end 正確的命令行是 指定 paired參數 mapping率低的 ...
2017-09-02 10:13 0 1824 推薦指數：
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