【轉】使用scipy進行層次聚類和k-means聚類
scipy cluster庫簡介 scipy.cluster是scipy下的一個做聚類的package, 共包含了兩類聚類方法: 1. 矢量量化(scipy.cluster.vq):支持vector quantization 和 k-means 聚類方法 2. 層次聚類 ...
原文：使用mothur進行OTU聚類
微生物 S的OTU聚類工具有很多，最常用的就是 usearch cdhit OTU mothur。 這些工具大多都是針對二代測序平台的，usearch的 bit版本是收費的。 如果要跑PacBio的OTU聚類，目前就只能用 mothur 了。 mothur有着非常詳細的說明文檔 General operations Sequence processing OTU based approaches ...
2017-06-09 15:40 0 4197 推薦指數：
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