【轉錄組入門】4：參考基因組和注釋文件
作業要求： 在UCSC下載hg19參考基因組，我博客有詳細說明，從gencode數據庫下載基因注釋文件，並且用IGV去查看你感興趣的基因的結構，比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作業，截圖幾個基因的IGV可視化結構！還可以下載ENSEMBL，NCBI的gtf，也導入IGV看看，截圖基因結構 ...
原文：關於基因組注釋文件GTF的解釋
GTF文件的全稱是gene transfer format，主要是對染色體上的基因進行標注。怎么理解呢，其實所謂的基因名，基因座等，都只是后來人們給一段DNA序列起的名字而已，還原到細胞中就是細胞核里面的一條長長的染色體 DNA序列 。而這個GTF文件的主要功能，就是指出我們所謂的基因在染色體上的位置 coordinate ，並且還標注了這一段區間的其他信息。 GTF文件我一般喜歡去ensemb ...
2017-06-06 10:44 0 10629 推薦指數：
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