有2種方式: 1、投遞到指定隊列 qsub -q all.q -cwd -V cmd.sh 2、投遞到指定節點 qsub -l hostname=node-01 -cwd -V cmd.sh 轉載:https://my.oschina.net/leopardlinux/blog ...
參考: Oracle Grid Engine qsub命令 SGE qsub使用范例 SGE作業基本用法 qsub是最為穩定的底層任務投遞系統,就是把一個腳本投遞到集群的計算節點上運行。 注意,只有登錄節點才有資格投遞任務,計算節點沒有權限投遞任務,只能執行,所以千萬不要在投遞的腳本內嵌套投遞,會報錯的。 下面是我最為常用的投遞命令: 先逐條解釋: cwd: 就是 current working ...
2017-01-14 17:26 0 3599 推薦指數:
有2種方式: 1、投遞到指定隊列 qsub -q all.q -cwd -V cmd.sh 2、投遞到指定節點 qsub -l hostname=node-01 -cwd -V cmd.sh 轉載:https://my.oschina.net/leopardlinux/blog ...
Hi Everyone. Share My Tips during This week. 今天對於qstat和qdel 做些基本介紹。屬於PBS(公開作業管理系統)的命令。 qstat 命令—用於查詢作業狀態信息。qdel 命令—用於刪除已提交的作業 假如xiaomi 是自己的名字,想看 ...
集群管理工具(SGE, Sun Grid Engine), 用於從登陸節點上向計算節點進行任務投遞 SGE或者其他集群管理工作做的事情就是將用戶投遞的任務進行排隊,然后將任務交給能夠運行的計算節點執行,工作流程可以分為四步: 接受用戶投放的任務 ...
用戶通過qsub命令來向系統提交任務,有兩種方式提交:腳本方式和命令行方式。(一般情況下,不允許root用戶使用qsub命令提交作業)。下面先講一下用這兩種方式提交作業的過程。腳本方式提交用戶將需要執行的程序或命令寫入腳本中,再加入一些必要或者可選的語句,就可以通腳本方式提交。腳本提交比較方便 ...
cd /xxx/genome_stat/Annotation ln -s /xxx/02.annotation/gff_v2/*.homolog.v2.gff /xxx/genome_stat/ ...
qsub qsub命令用來向SGE提交批處理作業,SGE支持單或多節點作業。 qsub [ options ] [ command | -- [ command_args ]] 1. -@ optionfile (contains all valid options) 就是把qsub命令 ...
安裝supervisor方法,可以直接用 yum install supervisord ,但是版本可能會舊一點,可以參考官方的方法: http://supervisord.org/instal ...
1、sge提交腳本qsub 1、qsub work.sh work.sh 不能以數字開頭 2、qsub work.sh 默認工作路徑為/home/username 3、qsub -cwd work.sh 為當前路徑 -wd 為指定路徑! 4、qsub -cwd -l ...