bwa的使用方法
bwa的使用需要兩中輸入文件： Reference genome data（fasta格式 .fa, .fasta, .fna） Short reads data (fastaq格式 .fastaq, .fq)step 1: 建立 Index根據reference genome ...
原文：【轉】GATK使用方法詳解（包含bwa使用）
一 使用GATK前須知事項： 對GATK的測試主要使用的是人類全基因組和外顯子組的測序數據，而且全部是基於illumina數據格式，目前還沒有提供其他格式文件 如Ion Torrent 或者實驗設計 RNA Seq 的分析方法。 GATK是一個應用於前沿科學研究的軟件，不斷在更新和修正，因此，在使用GATK進行變異檢測時，最好是下載最新的版本，目前的版本是 . . 。下載網站：http: www. ...
2015-12-30 16:45 0 4801 推薦指數：
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