RNA-seq數據分析中,為了鑒定兩個group 差異表達的基因,會針對每一個基因分別做假設檢驗(例如T-test),這里會出來一個P-value,但是往往R中專門做差異表達的package,還會有Adjusted-P 這么一個P-value。或者我們經常會碰到FDR這個概念。這些說的都是 ...
來源:http: blog.sina.com.cn s blog b c ed l a.html,http: wenku.baidu.com link url mRTbARl uPHHRFO CdqhBNeUj nb dRwtqRN oGqu u kN IsqgYy H ggB jOkPXhx oM YW ftfOlh dz KJmlliOhDa WZFEEus ,http: www.dxy.cn ...
2015-08-09 16:23 0 7639 推薦指數:
RNA-seq數據分析中,為了鑒定兩個group 差異表達的基因,會針對每一個基因分別做假設檢驗(例如T-test),這里會出來一個P-value,但是往往R中專門做差異表達的package,還會有Adjusted-P 這么一個P-value。或者我們經常會碰到FDR這個概念。這些說的都是 ...
寫在前面:之前一直對p值檢驗和假設檢驗的概念混淆不清,有時想明白了,再遇見又忘了。最近發現是由於我一直對顯著性水平的概念的理解有問題,才導致上述問題。下面不推公式,只是簡單寫下自己現在的理解: 一、假設檢驗 假設檢驗是給定原假設H0,備擇假設H1和顯著性水平α,現在我們手里有一個樣 ...
p-value是一種概率:在原假設為真的前提下,出現該樣本或比該樣本更極端的結果的概率之和。 例子: 我們假設 H0:出現正面的概率是1/2 扔硬幣20次出現了14次正面.該樣本的單邊p-value計算如下: 考慮雙邊檢驗時候,p-value是單邊 ...
當我們說到p-value時,我們在說什么? “這個變量的p-value小於0.05,所以這個變量很重要” ........ 你真的知道自己在說什么么???這個p-value到底是個什么鬼?為什么小於0.05就很重要?很重要是什么意思????? 終於... 這次 ...
當我們說到p-value時,我們在說什么? “這個變量的p-value小於0.05,所以這個變量很重要” ........ 你真的知道自己在說什么么???這個p-value到底是個什么鬼?為什么小於0.05就很重要?很重要是什么意思????? 終於... 這次,我們通俗易懂地來講講 ...
作者|GUEST 編譯|VK 來源|Analytics Vidhya 介紹 檢驗是統計學中最基本的概念之一。不僅在數據科學中,假設檢驗在各個領域都很重要。想知道怎么做?讓我們舉個例子。現在有一個lifebuoy沐浴露。 沐浴露廠商聲稱,它殺死99.9%的細菌。他們怎么能這么說呢?必須有 ...
總結起來就三句話: (1)當同一個數據集有n次(n>=2)假設檢驗時,要做多重假設檢驗校正 (2)對於Bonferroni校正,是將p-value的cutoff除以n做校正,這樣差異基因篩選的p-value cutoff就更小了,從而使得結果更加嚴謹 (3)FDR校正是對每個 ...
學習假設檢驗的基礎知識,包括如何設置假設檢驗。 統計學家規定了關於可能性或不可能性的三個常規級別:如果達到樣本均值的概率小於,0.05 即 5%,0.01 即 1% 或 0.001 即 0.1%,那么通常被視為不太可能發生。概率小於 0.1% 的情況是非常不可能的,這些叫做 α 水平。 現在 ...