tabix 可以對NGS分析中常見格式的文件建立索引,從而加快訪問速度,不僅支持VCF文件,還支持BED, GFF,SAM等格式。 下載地址: 由於snp數量多,所以vcf文件也非常大,常見做法用bgzip進行壓縮 壓縮之后,原本的view.vcf文件就變成 ...
bgzip Block compression decompression utilitytabix Generic indexer for TAB delimited genome position files SAMtoolsandBCFtoolsare distributed as individual packages. The code uses HTSlib internally, b ...
2015-06-14 10:27 0 6479 推薦指數:
tabix 可以對NGS分析中常見格式的文件建立索引,從而加快訪問速度,不僅支持VCF文件,還支持BED, GFF,SAM等格式。 下載地址: 由於snp數量多,所以vcf文件也非常大,常見做法用bgzip進行壓縮 壓縮之后,原本的view.vcf文件就變成 ...
利用bcftools軟件將vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具體如下: ...
--directory install 默認 給dest 加入執行權限 -b 無參 備份 --backup -p ...
系統變量SY-INDEX與SY-TABIX是用來記錄循環的次數或者索引的,不同的是SY-INDEX在DO....ENDDO中是有效的,而SY-TABIX在LOOP....ENDLOOP中及READ內表時獲取相應的索引。 DATA:BEGIN OF STUDENT OCCURS ...
install:install實際上是maven-install-plugin的目標。這與install maven生命周期階段不同。 Maven生命周期階段是構建中的某些步驟,某些插件可以將其自身綁定到。當您調用單個生命周期階段時,可能會執行來自不同插件的許多不同目標。 這歸結為命令 ...
ipython notebook  pip install msgpack ...
mvn install:install-file -Dfile=JAR包所在路徑(如D:/xxxx/x) -DgroupId=包的groupid名(可以是自己取的名) -DartifactId=包的artifactID名(可以是自己取的名) -Dversion=版本號(可以自己取的,例如1.0 ...
greenplum install 注意事項:1.hostname 不能大寫##2.如果segment和mirror副本數比較大,建議調整/etc/ssh/sshd_config的maxconnect數值3.系統參數需要修改kernel.sem = 500 1024000 200 8192 ...