一、为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36),rs124尾随其后(6.673e-22),也是与该表型显著相关,那么这个时候,我们就有问题 ...
因为没有在这一行真正干过,所以一些基本概念还不是很明确,这里作一个梳理。 看本领域的遗传学综述有感:The Emerging Genetic Landscape of Hirschsprung Disease and Its Potential Clinical Applications 问题: 什么是遗传分析genetic analysis 发展逻辑是什么 疾病和变异如何分类 mendelia ...
2022-03-16 23:03 0 651 推荐指数:
一、为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36),rs124尾随其后(6.673e-22),也是与该表型显著相关,那么这个时候,我们就有问题 ...
目录: overview download quick start 【Overview】 MAGMA是一个用于GWAS数据分析的软件,首次发表于文章: de Leeuw C, Mooij J, Heskes T, Posthuma D (2015 ...
遗传算法 前引: 1、TSP问题 1.1 TSP问题定义 旅行商问题(Traveling Salesman Problem,TSP)称之为货担郎问题,TSP问题是一个经典组合优化的NP完全问题,组合优化问题是对存在组合排序或者搭配优化问题的一个概括,也是现实诸多领域相似问题的简化 ...
求函数f(x) = xsin(10Π·x) + 2.0 x∈[-1,2]的最大值: 一、编码 设求解精度精确到6位小数,所以将区间 [-1,2] 分为 [2-(-1)]×106 = 3×106 ...
2017-12-17 19:12:10 一、Evolutionary Algorithm 进化算法,也被成为是演化算法(evolutionary algorithms,简称EAs),它不是一个具体 ...
有很多概念需要明确区分: 人有23对染色体,其中22对常染色体autosome,另外一对为性染色体sex chromosome,XX为女,XY为男。 染色体区带命名:在标示一特定的带时需要包括4项 ...
一、遗传算法原理介绍 遗传算法(Genetic Algorithm)是模拟达尔文生物进化论的自然选择和遗传学机理的生物进化过程的计算模型,是一种通过模拟自然进化过程搜索最优解的方法。遗传算法是从代表问题可能潜在的解集的一个种群(population)开始的,而一个种群则由经过基因(gene ...
遗传方差:遗传方差又称表型方差(phenotypic variance),通常结合基因型方差(genotype variance)和环境方差(environmental variance)。遗传方差主要包括三方面:加性遗传方差(Additive genetic variance)、显性遗传方差 ...