原文:bedtools 定量表达:coverage 统计 reads 数(加-sorted参数)

最近做定量表达,使用了命令如下: bedtools coverage a all.bed b file.sort.bam gt file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多时候会出现Bus error或者Killed的报错 能不能正常运行,很大程度上取决于系统的资源。 后来,经老师提醒,我可以加个 sorted参数,如下所示: bedtools coverage sorted ...

2022-02-14 21:12 0 1473 推荐指数:

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lncRNA表达定量方法评估

见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...

Tue Mar 27 23:42:00 CST 2018 0 881
量表达式(constexpr)

首先,常量表达式的概念:在编译期就可以计算出结果的表达式 那么为什么要用常量表达式呢,用常量表达式会有什么好处:   1.允许一些计算只在编译时进行一次,而不是每次程序运行时;   2.编译器可以进行尺度更大的优化;   3.可以用在需求编译期间常量的上下文,例如数组长度等; 使用 ...

Wed May 22 03:12:00 CST 2019 0 1980
java 常量表达

原文地址:http://docs.oracle.com/javase/specs/jls/se8/html/jls-15.html#jls-15.28 这是我翻译的,以备不时之用。 常量表达式是一个代表基本数据类型或者String数据类型的表达式,是在编译期间能计算出来的值.由以下几点 ...

Sun Mar 29 22:35:00 CST 2015 1 1957
仓中的全量表、增量表、拉链表、流水表、快照表

量表:每天的所有写最新状态的数据 1、有无变化,都要报 2、每次上报的数据都是所有的数据(变化的+没有变化的) 增量表:新增的数据 1、增量表,只报变化量,无变化不用报 拉链表: 1、记录一个事物从开始,一直到当前状态的所有变化的信息 2、拉链表每次上报的都是历史记录的最终状态 ...

Thu Apr 30 21:24:00 CST 2020 0 1249
 
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