见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
最近做定量表达,使用了命令如下: bedtools coverage a all.bed b file.sort.bam gt file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多时候会出现Bus error或者Killed的报错 能不能正常运行,很大程度上取决于系统的资源。 后来,经老师提醒,我可以加个 sorted参数,如下所示: bedtools coverage sorted ...
2022-02-14 21:12 0 1473 推荐指数:
见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
featureCounts真的很厉害。 常见的参数(没什么好说的,毕竟是固定的): -a -o input_file1 -F -t -g -Q -T 关键是以下几个参数怎么设置: -f # Perform read counting at feature ...
这两天有一个使用flink sql的实时流项目,需要在每个结果中标记当前时间。因为flink没有获取当前时间的函数,于是我自己定义了一个udf: 然后注册成currentUnixTim ...
首先,常量表达式的概念:在编译期就可以计算出结果的表达式 那么为什么要用常量表达式呢,用常量表达式会有什么好处: 1.允许一些计算只在编译时进行一次,而不是每次程序运行时; 2.编译器可以进行尺度更大的优化; 3.可以用在需求编译期间常量的上下文,例如数组长度等; 使用 ...
原文地址:http://docs.oracle.com/javase/specs/jls/se8/html/jls-15.html#jls-15.28 这是我翻译的,以备不时之用。 常量表达式是一个代表基本数据类型或者String数据类型的表达式,是在编译期间能计算出来的值.由以下几点 ...
正题 一般公司只是简单分成 全量表,增量表,和拉链表。所以重点关注如下三个表就OK了。 全量表: ...
全量表:每天的所有写最新状态的数据 1、有无变化,都要报 2、每次上报的数据都是所有的数据(变化的+没有变化的) 增量表:新增的数据 1、增量表,只报变化量,无变化不用报 拉链表: 1、记录一个事物从开始,一直到当前状态的所有变化的信息 2、拉链表每次上报的都是历史记录的最终状态 ...
源代码见文末 部分源代码: ...