原文:TCGA | CCLE | 数据挖掘基本教程 | GTEx

年 月 日 还好没有走上纯生信的灌水之路,要扎扎实实的搞干湿结合,只有问题问好了 实验设计好了 数据测好了,生信才能迸发出高能的威力 TCGA数据下载 基本的TPM表达数据 全网最全 TCGA新版数据下载与整理教程来了 来抄作业 单基因泛癌 CCLE数据下载及整理 从GTEX官网下载表达谱数据并与表型文件整理合SummarizedExperiment格式 How do I compare tum ...

2021-12-30 14:14 0 1588 推荐指数:

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GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手

转自生信菜鸟团,如有侵权j,请联系微信:biozhangz进行删除. GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手 Posted on 2018年11月26日 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有他的正常 ...

Sun Apr 12 02:45:00 CST 2020 0 1861
TCGA数据挖掘 | 免疫细胞浸润分析

问题: 什么是免疫细胞浸润? 肿瘤组织里都有哪些细胞?有哪些免疫细胞? 免疫细胞浸润分析的基本原理?相关性 bulk RNA-seq拆分scRNA-seq的原理 免疫浸润评估常 ...

Tue Feb 08 02:42:00 CST 2022 0 2987
数据挖掘入门系列教程(结束)

从无到有,陆陆续续一个数据挖掘入门系列的教程就写了18篇博客了,这个是我没有想到的,本来以为可能写10篇博客就结束了,但是写着写着写着写着就写了这么多: 数据挖掘入门系列教程(一)之亲和性分析 数据挖掘入门系列教程(二)之分类问题OneR算法 数据挖掘入门系列教程 ...

Wed May 13 00:38:00 CST 2020 0 585
数据挖掘面试

问题一: 你简历中上过的数据挖掘、机器学习等课程,是学校的研究生课程还是自己单独学习的;回答道:研究生课程有学习,自己单独私下也有学习 1、监督学习和无监督学习的区别?分类回归一般属于哪种?聚类属于哪种?请举例你知道的相关有监督学习和无监督学习算法 1:监督学习和无监督学习的区别 ...

Wed Nov 20 17:31:00 CST 2019 0 561
数据挖掘-基本流程

1、定义目标 2、获取数据 3、数据探索 4、数据预处理(数据清洗-去掉脏数据数据集成-集中、数据变换-规范化、数据规约-精简) 5、挖掘建模(分类、聚类、关联、预测) 6、模型评价与发布 ...

Tue Jan 10 03:51:00 CST 2017 0 3835
神奇的数据挖掘

谈到BI,就会谈到数据挖掘(Data mining)。数据挖掘是指用某些方法和工具,对数据进行分析,发现隐藏规律并利的一种方法。下面我们将通过具体的例子来学习什么是数据挖掘。 案例“上大学分析”-体验什么是数据挖掘 某社会机构,收集 ...

Thu Oct 10 01:03:00 CST 2013 36 6352
数据挖掘入门

当前工作上需要上对数据进行处理分析,以辅助运营部门工作。在此记录下一些过程,以总结提高。 准备 由于第一次接触数据分析以供其他部分同事使用的工作,所以走了一些弯路。一开始的时候是阅读一些大数据分析的书籍,这些书籍基本都是从工具角度去进行介绍,而没有从总体的角度去解析这种事情。所以对初期工作 ...

Mon Dec 15 09:23:00 CST 2014 8 1757
数据挖掘模型

挖掘建模根据挖掘目标和数据形式可建立:分类与预测、聚类分析、关联规则、时序模式、偏差检测等模型 1.分类与预测 分类与预测是预测问题的两种主要类型,分类主要是:预测分类标号(离散属性);预测主要是:建立连续值函数模型,预测给定自变量对应的因变量的值。 1.1 实现过程 (1)分类 ...

Mon Jan 22 07:25:00 CST 2018 1 10001
 
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