原文:[GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析

前言 在生物信息学数据分析中,许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY Gene Set Enrichment Analysis in Python GSEApy is a python wrapper forGESAandEnrichr. It s used for convenient GO enrichments an ...

2021-12-27 18:21 0 2524 推荐指数:

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GSEA-基因富集分析

Analysis 思路: 使用预定义的基因(通常来自功能注释或先前实验的结果),将基因按照在两类样本中的差 ...

Thu Aug 30 01:40:00 CST 2018 0 19018
基因或蛋白富集分析,gsea与ssgsea

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Sun Jul 05 20:40:00 CST 2020 0 4712
python scipy包进行GO富集分析p值计算

最近总是有需要单独对某一个类型的通路进行超几何分布的p值计算,这里记录一下python包的计算方法 使用scipy的stat里面的hypergeom.sf方法进行富集分析的p值计算 hsaxxxxx AA and Linoleic metabolism KEGG pathways ...

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