原文:NCBI的gene id, ENTREZID 与Ensembl Gene ID的转换

NCBI的gene id, ENTREZID 与Ensembl Gene ID 互相转换网站:https: biodbnet abcc.ncifcrf.gov db db db.php 还有另外一个单向 ensemble 转NCBI的:https: www.biotools.fr human ensembl symbol converter ...

2021-12-24 21:51 0 3702 推荐指数:

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gene IDgene symbole,EnsembleID

gene symbol: TP53 gene ID:7157。Entrez Gene ID,它是目前国际上最权威的Gene ID编号! GENECODE:GENECODE来自Ensembl数据库。没有ID。它有gtf文件。 HGNC(人类基因命名委员会)只对人类基因进行命名 ...

Tue Oct 15 16:50:00 CST 2019 0 1688
NCBIgene系列

1、基因系列中的data索引 2、基因ID之间的转换 对于生信,依托于别人的工具不如自己动手,由于研究发表的滞后性,往往很多工具提供的转换并不是最新的,况且开发者水平也参差不齐,理解原理才能让你来去自如。 今天主要记录几个ID转换的方式: 以果蝇为例 详细的了解阅读下面:ftp ...

Mon Jan 14 03:20:00 CST 2019 0 597
Gene Ontology (GO) 简介

为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...

Tue Mar 20 04:54:00 CST 2012 0 6610
【GEO】【R语言】GEO探针转换Gene name symbol

【怪毛匠子整理】 一、使用SOFT文件 1. 确定GEO平台,比如GPL25318, 通过NCBI找到这个平台,也可以通过下面的链接,把GPL25318 替换成你想要的平台ID。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi ...

Tue Apr 14 00:59:00 CST 2020 2 3580
Gene Ontology (GO) 注释

Gene Ontology (GO) 注释 Posted on 2017-06-11 | In 生信 相似的基因在不同物种中,其功能往往保守的。显然,需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能,否则,不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同,将极大限制学术 ...

Fri Jul 12 00:43:00 CST 2019 0 530
如何研究某个gene的ceRNA 网络

研究人员针对 PTEN 这个关键的抑癌基因,来探究调控该基因表达的ceRNA 网络; 分析策略: 1)预测能调控该基因的miRNAs 通过miRanda 软件预测和实验验证相结合的方式,挑选 ...

Tue May 02 22:12:00 CST 2017 0 1870
 
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