原文:plink 阈性状(质量性状)GWAS分析

plink进行阈性状 质量性状 关联分析有两种方法 assoc 和 logistic, 这两种方法又分别有分是否校正: assoc adjust 和 logistic adjust logistic方法有可以选择是否添加协变量: logistic covar 和 logistic adjust covar 这么算的话一共有 种组合。 测试数据 assoc assoc adjust命令 logist ...

2021-12-17 23:47 0 1692 推荐指数:

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Rest(表述性状态转移)

本文的主要内容有: 1.了解Rest 2.了解RESTful WebService 3.使用SpringMvc实现RESTful ------------------------------我 ...

Fri Nov 04 02:58:00 CST 2016 1 1523
功能性状的谱系信号与谱系独立比较的分析方法-代码分析

功能性状的谱系保守性分析是架起进化历程与生态过程的重要桥梁,是很多高阶分析的基础。谱系保守性是很多基于谱系的预测模型的基本前提,比如生态位模型、达尔文归化假说、预适应假说。去除谱系保守性的影响,是跨物种进行性状相关性分析的前提(侧重于适应性的协同进化分析,而非系统发育分析)。 本次分享于2021 ...

Thu Apr 01 17:57:00 CST 2021 5 579
Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因组复杂性状分析

GCTA(全基因组复杂性状分析)工具开发目的是针对复杂性状的全基因组关联分析,评估SNP解释的表型方差所占的比例(该网站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可实现以下功能: 1 评估全基因组SNP的亲缘关系(遗传关系) 2 评估全 ...

Sat Oct 22 06:03:00 CST 2016 0 1416
第四章 数量性状遗传

第一讲 数量性状的概念与遗传特点 一、质量性状 1、质量性状如贝壳颜色,豌豆花色,籽粒的饱满程度等性状(可以明显发现) 2、表型之间截然不同,具有质的差别,用文字描述的性状称为质量性状 3、在群体中呈间断发布 二、数量性状 1、如新生儿的身高体重,作物的产量,奶牛的泌乳量,棉花 ...

Thu Jun 24 22:50:00 CST 2021 0 180
SKU多维属性状态判断算法

作者:周琪力,前端工程师,网络常用昵称「keelii」。在过去的4年里主要负责京东网站商品详情页的前端系统架构和开发,平时主要写 JavaScript 偶尔写点NodeJS,Python。琪力博客: ...

Mon Oct 15 19:56:00 CST 2018 0 1343
plink 进行PCA分析

当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用plink进行主成分(PCA)分析; 一、软件安装 二、使用流程 第一步:将vcf转换为plink格式 上述会得到.map, .nosex和.ped结尾的三个文件。 第二步 ...

Sun Apr 26 22:00:00 CST 2020 0 3506
两对等位基因控制一对相对性状的规律(基因互作)

两对等位基因控制一对相对性状的规律(基因互作) 参考文档:https://wenku.baidu.com/view/edf42b6682c4bb4cf7ec4afe04a1b0717fd5b3e1.html?from=search 基因互作是指几对等位基因之间通过相互作用影响同一性状 ...

Mon Jul 29 01:17:00 CST 2019 0 2579
 
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