如果只有SNP的染色体和物理位置信息，该如何批量转换得到 rs ID？ 思路非常简单，只需要下载 dbSNP 的参考文件，根据位置信息从参考文件中获取对应的 rs 编号即可。 下面列举两个例子。 重命名 PLINK 文件 SNP 名字 第一个例子是 PLINK 格式的文件，要把 ...

1.基因染色体定位TBtools Graphics-show gene on chr-第一个 文件准备： ①染色体长度信息 ②基因位置信息 #①：染色体长度文件 用基因组序列提取每条染色体的长度信息，结果是NC_开头的基因组编号，不是染色体号 记录 ...

提取fasta文件genome_test.fa中第14号染色体的序列，其内容如下： >chr1 ATATATATAT >chr2 ATATATATATCGCGCGCGCG >chr3 ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT >chr4 ...

cat snpeff.vcf | java -jar SnpSift.jar filter " ( POS >= 122 ) & ( POS <= 124 ) & ( CHROM = 'chr1' ) " > spe_snpeff.vcf 提取一号染色体 ...

资料来源： 细胞、染色体、DNA和基因的关系 细胞核中包含染色体，人体共有23对染色体（22+XY/XX），染色体由DNA组成，DNA是由互补碱基对组成的双螺旋结构，DNA链中只有一部分信息可以编码为蛋白质，这些蛋白质是构成细胞和组织最小的组成成分，这些有效编码的部分称为gene，而不能有效编码 ...

欢迎来到"bio生物信息"的世界 1 前言 早期的研究普遍只做常染色体的全基因组关联分析，很少做性染色体的。 主要原因是性染色体的遗传模式比较复杂，存在X染色体失活，而且男女效应值不大一样。 其次，也不是所有的表型都是男女有差异的。 再然后，也没有很好的工具计算性染色体的关联分析 ...

3D-DNA是一款简单，方便的处理Hi-C软件，可将contig提升到染色体水平。其githup网址：https://github.com/theaidenlab/3d-dna 3D-DNA流程简介 将Hi-C数据比对到draft.genome.fa。（利用Juicer分析Hi-C ...

1、准备测试数据 2、依据染色体拆分数据 [root@linuxprobe test]# wc -l *.map 1649 chr10.map 1077 chr11.map 1528 chr12.map 1527 chr13.map 1045 ...