转录组分析工具大比拼 文献阅读与翻译 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis (Nature ...
转载来自https: zhuanlan.zhihu.com p 写的非常好 怕找不到留着自己看 如果作者不同意我会删除。 前言 接下来我们要介绍的是RNA seq数据的处理分析流程,根据RNA seq测序技术的不同,可以分为三种: Stark et al. Nat Rev Genet short read long read direct RNA seq 而我们一般的RNA seq测序数据分析流程 ...
2021-11-17 23:05 0 7025 推荐指数:
转录组分析工具大比拼 文献阅读与翻译 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis (Nature ...
转录组分析的正确姿势 转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。 转录组的测序分析也相对成熟,从RNA提取、构建文库、上机测序再到结果解析既可以自己完成 ...
Reference : https://cloud.tencent.com/developer/article/1703051 https://blog.csdn.net/weixin_44452 ...
转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 转载▼ 标签: 生物信息学 转录组 1.Hisat2建立 ...
转录组分析流程(有参和无参de novo) 获得测序数据,Fastq格式,称之为Raw data。 质量检测 比对Mapping Quantification|Quantitation 差异表达分析 补充:开始项目之前,先确立合理的文件目录结构 ...
数据来源:Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at H3K27 in Arabidopsis;GSE79524 我只试做了转录组分析那一部分。简单概括就是为了评估乙酰化对基因表达的影响 ...
和MetaXcan工具进行全转录组分析(Transcriptome-Wide Analysis) 该工具最大 ...
上的,各自具有不同的表达调控模式。基因家族的鉴定,是进化分析很重要的一个方面; OrthoMCL(htt ...