原文:文献(5): 单细胞转录组揭示人类纤维化皮肤病中成纤维细胞的异质性

一句话评价:小样本量单细胞转录组在冷门疾病领域应用前景尚可,常规套路也能发NC . Title 标题可以看出本研究的主要内容: 构建成纤维细胞的图谱 揭示成纤维细胞的异质性 找到一群 相对于正常样本 在纤维化皮肤病中含量升高的间充质成纤维细胞 . Background 纤维化的特点是成纤维细胞增殖 迁移 侵袭能力增加以及胞外基质 ECM 的过度积累,在全球范围内都有较高的发病率和死亡率。 纤维化 ...

2021-10-23 01:24 0 215 推荐指数:

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文献(2): 综述_癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性【建议收藏】

上一个单细胞课题做了一些关于CAF的工作,当时就参考了这一篇综述。细胞亚群的解读算是单细胞课题中耗时耗力的内容,非免疫细胞更是如此,因为非免疫细胞文献比免疫细胞少多了。这一篇综述系统总结了2020年之前单细胞领域CAF的一些工作,值得仔细读读。我个人觉得CAF是TME里面比较有趣的一块内容 ...

Wed Mar 10 00:13:00 CST 2021 0 1098
单细胞分析实录(16): 非负矩阵分解(NMF)检测细胞异质性

相信做过肿瘤单细胞的小伙伴对这个分析并不陌生,如果多读几篇文献,就能在CNS以及大子刊上面看到这个分析。 非负矩阵分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法。 基本思想:给定一个非负矩阵V, NMF ...

Sat Jun 26 04:14:00 CST 2021 0 216
单细胞转录测序技术原理

From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因测序和转录测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因测序目前主要有两种扩增 ...

Wed Jun 30 17:19:00 CST 2021 0 525
单细胞转录CNV分析

什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...

Fri May 07 22:49:00 CST 2021 0 210
单细胞空间转录 | scRNA-seq

实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录的分析、可视与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...

Fri Dec 17 03:02:00 CST 2021 0 138
单细胞转录测序技术(scRNA-seq)及细胞分离技术分类汇总

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...

Sat Sep 07 23:23:00 CST 2019 0 1442
 
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