FASTA/Q序列处理神器---seqkit
该软件对于处理FASTA/Q十分方便，省去自己编写脚本 安装 使用 序列操作（seq） Fasta/q之间以及与tab格式互换 序列信息统计 ...
原文：seqkit | 序列处理利器 | fastq | fasta | barcode提取 | Cell Ranger | 荧光标记比对
有时候需要个性化处理原始序列，自己写python脚本太慢，且速度太慢，可以用seqkit这个工具，开发得不错。 年 月 日 另一个需求：需要从Cell Ranger处理后的bam文件里提取出未比对的reads，然后再去比对到YFP序列上，确定每个细胞是否被YFP标记了。 参考 ：Cell Ranger的bam文件的解读Barcoded BAM The cellranger pipeline out ...
2021-10-18 18:14 0 126 推荐指数：
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