1.染色质开放性测试技术 https://zhuanlan.zhihu.com/p/31924355 首先正常的DNA都是卷起来的,只有在表达时才会展开,也就是开放,术语上说就是具有可接近性,那么ATAC-seq就是测这些染色质开放性的技术。 原理: 人为地将这些DNA序列 ...
染色质可及性 Chromatin accessibility 是核内大分子能够物理接触染色质化DNA的程度,由核小体的占据和拓扑结构以及阻碍DNA可及性的其他染色质结合因子决定。 ...
2021-10-10 21:26 1 1806 推荐指数:
1.染色质开放性测试技术 https://zhuanlan.zhihu.com/p/31924355 首先正常的DNA都是卷起来的,只有在表达时才会展开,也就是开放,术语上说就是具有可接近性,那么ATAC-seq就是测这些染色质开放性的技术。 原理: 人为地将这些DNA序列 ...
,把细胞内的DNA与蛋白质交联(Crosslink)后裂解细胞,分离染色体,通过超声或酶处理将染色质随机切割 ...
RNA-seq这个工具该什么时候用?ATAC-seq该什么时候用?有相当一部分项目设计不行,导致花大钱测了一些没有意义的数据。 还是在中心法则这个框架下来解释,这是生物信息的核心。打开华大科技服务官 ...
表观遗传 表观遗传的3个机制:DNA甲基化;组蛋白修饰;chromatin remodeling 开放染色质测序: 参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/49461012 研究目的:研究细胞的转录调控。 细胞的大部分时间处于 ...
目录 3C简介 技术类型及区别 数据下载 基本应用 3C简介 核心理念就是把真核细胞核里的DNA三维折叠结构给测序出来,一个最经典的模型就是远距离enhancer可以促进转录。 真核生物细胞核中的染色质通过折叠成高度动态、复杂的高级结构,调控基因的转录、复制,以及损伤修复等重 ...
欢迎来到"bio生物信息"的世界 1 前言 早期的研究普遍只做常染色体的全基因组关联分析,很少做性染色体的。 主要原因是性染色体的遗传模式比较复杂,存在X染色体失活,而且男女效应值不大一样。 其次,也不是所有的表型都是男女有差异的。 再然后,也没有很好的工具计算性染色体的关联分析 ...
周质空间(Periplasmicspace)又称周质或壁膜空间。在细菌中,一般指其外膜与细胞壁之间的狭窄空间(宽约12-15nm),呈胶状。 周质空间(Periplasmicspace)又称 周质或壁膜空间。在革兰氏阴性菌中,一般指其外膜与细胞膜之间的狭窄空间(宽约12-15nm),呈胶状 ...
一、质谱仪 1. 质谱与质谱仪 质谱仪是一类物质分析仪器,它将分析样品转化成带电离子并根据质荷比实现分离,检测质荷比相对强度后生成质谱图进行分析。 由于检测质荷比的特性,质谱仪可以确定化合物的质量进而确定化合物的分子式。并且,根据中间产物的性质,质谱仪甚至可以唯一地确定某些化合物的结构式 ...