一行命令批量修改染色体和位置为RS号
鉴于太多人问我怎么批量根据chr:pos查找RS号，在这里出一个教程。 注意以下教程展示的是修改hg19基因组版本的RS号，如果你的数据是其他版本的，请修改为对应版本的数据。 假定数据是test.txt，内容如下： 现在希望根据第一列chr:pos找到对应的RS号，实现 ...
原文：依据SNP染色体和位置信息批量转换rs编号
如果只有SNP的染色体和物理位置信息，该如何批量转换得到 rs ID 思路非常简单，只需要下载 dbSNP 的参考文件，根据位置信息从参考文件中获取对应的 rs 编号即可。 下面列举两个例子。 重命名 PLINK 文件 SNP 名字 第一个例子是 PLINK 格式的文件，要把 .bim 文件中的 SNP 名字改为 rs id。 首先从 UCSC 下载纯文本格式的 dbSNP release 并解压 ...
2021-09-14 11:42 0 208 推荐指数：
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