SNPEFF snp注释 (添加自己基因组)

之间介绍过annovar进行snp注释,今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants ...

Mon Jun 03 06:02:00 CST 2019 0 1247
Eclipse添加自定义注释

   首先介绍几个常用的注解: @author 作者 @date 日期 @version 版本标识 @parameter 参数及其意义 @return 返回值 @throws 异常类及抛出条件 @deprecated 引起不推荐使用的警告 @override ...

Sun Jun 23 20:53:00 CST 2019 0 447
snpEff 对snp进行功能注释

主页使用说明http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html。 下载解压即可使用(java)。 一、建库 (1)已有2500个基因组的库,直接下载。 查看已有库:$ java -jar snpEff.jar databases 下载库 ...

Mon Mar 19 23:43:00 CST 2018 0 1656
【不费脑筋系列】为程序添加注释模板/版权注释/自定义头部注释

大佬们如果经常遇到要写注释,但是手写又那么费时间,并且存在有格式标准化的情况下,可以试试使用注释模板进行配置。教程如下: 1、找到对应的VS所安装的路径下。例如我的VS2022版本安装路径,如下所示,然后找到对应的版本文件夹,例如我的是企业版,对应的是 Enterprise ...

Mon Nov 15 02:51:00 CST 2021 0 170
Augustus 进行基因注释

目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq数据作为先验模型进行预测 ...

Tue Apr 07 17:04:00 CST 2020 0 964
Augustus 进行基因注释

目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是 AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq ...

Tue Feb 25 16:48:00 CST 2020 1 2544
Idea在方法和类上添加自定义注释模板

Idea在方法和类上添加自定义注释模板: 1.类注释注释模板: 编辑变量: 效果: 输入add提示addC,回车: 2.方法注释注释模板: 编辑变量: params的值为: 效果 ...

Thu Sep 02 05:42:00 CST 2021 0 109
 
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