使用ggplot2在地图上绘制散点图 ...
散点图是将所有的数据以点的形式展现在直角坐标系上,以显示变量之间的相互影响程度,点的位置由变量的数值决定,每个点对应一个 X 和 Y 轴点坐标。 散点图可以使用 plot 函数来绘制,语法格式如下: plot x, y, type p , main, xlab, ylab, xlim, ylim, axes x横坐标 x 轴的数据集合 y纵坐标 y 轴的数据集合 type:绘图的类型,p 为点 l ...
2021-08-19 19:02 0 261 推荐指数:
使用ggplot2在地图上绘制散点图 ...
前几天分析了一批单细胞TCR的数据,需要画这样一个图: 行是不同的样本,列是不同的T细胞类型,每一个位置点的大小表示T细胞的数目多少,并且还需要根据T细胞所属的克隆型类型涂色。这个图用来描述TC ...
这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change)。单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清。 示例数据df1是转录组做差异表达后的部分 ...
散点图用于描述两个连续性变量间的关系,三个变量之间的关系可以通过3D图形或气泡来展示,多个变量之间的两两关系可以通过散点图矩阵来展示。 一,添加了最佳拟合曲线的散点图 使用基础函数plot(x,y)来绘制散点图,其中x和y是数值型向量,代表着图形中的点(x,y) abline ...
ggplot2包中绘制点图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变点的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对点分箱的方法有两种:点 ...
绘制散点图(scatterplots)使用geom_point()函数,气泡图(bubblechart)也是一个散点图,只不过点的大小由一个变量(size)来控制。散点图潜在的最大问题是过度绘图:当一个位置或相邻的位置上出现有多个点,就可能把点绘制在彼此之上, 这会严重扭曲散点图的视觉外观 ...
属于比较常用的技巧。下面我用ggplot2内置数据集进行演示: 先来看一下,仅有散点和拟合线的图 如果想添加拟合的方程,可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()函数,该函数可以拟合多项式方程并生成多种标签,比如p值、决定系数R方,这些由函数计算出来的量通常名称 ...
第十一章中级绘图 本章内容: 二元变量和多元变量关系的可视化 绘制散点图和折线图 理解相关图 学习马赛克图和关联图 本章用到的函数有: plot hexbin ablines iplot ...