视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 ...
核心概念 Splice Site SS 位于外显子与内含子的交界处,能够被剪接体 spliceosome 识别的内含子序列。 分为 ss donor site ss acceptor site 。 ss中的 指的是 intron ss中的 指的是 intron Branching Point BP 位于内含子 ss上游 nt内 的部分保守序列,在剪接过程中能与 ss结合形成分支。 Note. Fr ...
2021-08-04 11:10 0 106 推荐指数:
视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 ...
单细胞转录组确实是利器,但我们大多只利用了表达的信息,而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章,讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
可变剪切的预测已经很流行了,目前主要有两个流派: 用DNA序列以及variant来预测可变剪切;GeneSplicer、MaxEntScan、dbscSNV、S-CAP、MMSplice、clinVar、spliceAI 用RNA来预测可变剪切;MISO、rMATS、DARTS ...
冷冻电镜 为什么冷冻电镜 (Cryo-EM) 技术的发明可以获得2017诺贝尔化学奖?知乎看法 Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2017 ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...
推荐关注微信公众号:AIPuFuBio,和使用免费生物信息学资源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com。 【Circular RNA的产生机制】 Circular RNA,缩写为circRNA,中文名为环状RNA,属于非编码RNA,是近年的一个重要研究热点 ...
scRNA-seq做完该做的QC、normalization、imputation、clustering、trajectory和integration,就会开始做转录调控的分析了。 核心就是围绕着TF转录因子做文章 预测TF的靶基因 鉴定regulon 大部分都是高通量的预测 ...
基本问题: RNA的起源、定位和意义 明确RNA的各种概念分类 各种RNA的基本结构和功能 意义 有一种学说:RNA是生命的起源。 先有鸡(DNA)还是先有蛋(蛋白质),好像都不太可能,那有没有可能先有RNA?桥接了DNA和蛋白质,RNA本身也是一种酶 ...