单细胞分析实录(18): 基于CellPhoneDB的细胞通讯分析及可视化 (上篇)
细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息，这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合，传递信号来实现的。不同的分化、疾病过程，可能存在特异的细胞通讯关系，因此阐明这些通讯关系至关重要。 CellPhoneDB配有详实的受配体数据库，其整合了此前的公共数据库，还会手动矫正，以得到 ...
原文：单细胞分析实录(19): 基于CellPhoneDB的细胞通讯分析及可视化 (下篇)
在上一篇帖子中，我介绍了CellPhoneDB的原理 实际操作，以及一些值得注意的地方。这一篇继续细胞通讯分析的可视化。 公众号后台回复 获取本次演示的测试数据，以及主要的可视化代码。 所有的数据和结果文件均已打包，下载后直接就能跑下面的代码画图。 下面的代码可以绘制对称热图 如果你不清楚为啥热图要沿着对角线对称，可以看一下之前的推文 还可以用网络图表示互作关系的数量 代码如下 气泡图 具体的互作 ...
2021-07-25 13:14 0 389 推荐指数：
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