原文:答读者问(1):非模式物种找marker;如何根据marker定义细胞类型

下午花了两个小时回答读者的疑问,觉得可以记录下来,也许能帮到一部分人。 第一位读者做的是非模式物种的单细胞。 一开始以为是想问我非模式物种的marker基因在哪儿找,读者朋友也提到了blast 研究的主要细胞类型的marker是有的 让读者朋友困惑的是一张表,cluster乘样本的表,每一个值表示表达这个marker基因的细胞数目。这个表其实没有多少信息,且容易给人误导。应该直接从小提琴图看。 ...

2021-07-23 10:08 0 142 推荐指数:

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大话重构 之 读者

越来越多人关注《大话重构》系列,一码感谢大家的支持。从系列开始到现在,有提出疑问的,有说好的,有说坏的,一码在此一并回答。 :单篇篇幅长,知识点多,看起来很吃力 :如果觉得有难度,不要气馁,你学习的机会就在眼前。《大话重构》的每篇文章都针对一种代码坏味道,务求讲清“坏”在哪儿,有哪些方法 ...

Tue Jun 09 02:37:00 CST 2015 8 838
细胞分析实录(9): 展示marker基因的4种图形(二)

在上一篇中,我已经讲解了展示marker基因的前两种图形,分别是tsne/umap图、热图,感兴趣的读者可以回顾一下。这一节我们继续学习堆叠小提琴图和气泡图。 3. 堆叠小提琴图展示marker基因 相比于其他可视化形式,小提琴图可以更直观地展示某一类亚群的某一个基因的表达分布情况 ...

Wed Mar 03 06:25:00 CST 2021 0 946
细胞分析实录(8): 展示marker基因的4种图形(一)

今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图:tsne/umap图、热图、堆叠小提琴图、气泡图,每个图我都会用两种方法绘制。 使用的数据来自文献:Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune ...

Sat Jan 09 06:29:00 CST 2021 0 2314
leaflet之自定义marker Icon

leaflet之自定义marker Icon marker图标可以设置自定义的图片,以及阴影图片 准备图片 创建原始图标ICON 依据原始图标创建多个图标ICON 创建marker设置icon添加到地图上 点击查看完整教程 leaflet入门系列教程 ...

Thu Sep 06 17:53:00 CST 2018 0 961
Leaflet中自定义marker的icon图标

场景 Leaflet中添加标记、折线、圆圈、多边形、弹窗显示点击处坐标: https://blog.csdn.net/BADAO_LIUMANG_QIZHI/article/details/122309679 在上面加载标记使用的是默认图标,如果要自定义图标怎么用。 官网有详细的教程 ...

Wed Jan 05 22:29:00 CST 2022 0 1668
GMap.Net开发之自定义Marker

上一篇文章介绍了如何在WinForm和WPF中使用GMap控件,这篇介绍下GMap中Marker的使用。 自定义Marker,可以理解为在地图上自定义图标(Custom Marker),先看看GMap的地图和图标的显示方式: Map控件上可以添加Overlay(图层),可以添加多个图层,先 ...

Sun Dec 15 23:33:00 CST 2013 47 22286
SVG.js Marker标记和自定义标签

一、SVG.Marker 添加标记 SVG.Marker 标记可以被添加到一个线,折线的各点,多边形和路径。有三种类型的标记:开始,中间和结束。如果开始表示第一个点,则结束中间的最后一点和中间点。 2.实例 二、SVG.Bare ...

Sun Apr 02 19:31:00 CST 2017 2 3247
 
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