上的,各自具有不同的表达调控模式。基因家族的鉴定,是进化分析很重要的一个方面; OrthoMCL(htt ...
目录 一 研究内容 .比较基因组分析 . 核心基因 非必需基因分析 泛基因组大小模拟 核心基因 非必需基因功能富集 核心基因 非必需基因保守性分析 核心基因 非必需基因与重复序列相关性分析 核心基因 非必需基因表达水平分析 .结构变异分析 SVs特征分析 核心 非必需SVs累计分析 图形结构基因组构建 SVs对基因结构的影响 SVs对基因表达的影响 二 技术策略 样本选择 测序策略 备注:本文主 ...
2021-07-22 23:30 0 279 推荐指数:
上的,各自具有不同的表达调控模式。基因家族的鉴定,是进化分析很重要的一个方面; OrthoMCL(htt ...
套路 这通常就是基因组组装后的必做分析,通过比较基因组学的手段进行分析,可以知道所研究物种在进化过程中哪些核心基因家族发生了变化,从而导致了其特殊的适应性机制的形成。 参考: Extremotolerant tardigrade genome and improved ...
第一代无创产前诊断是通过染色体倍数异常来判断的,最典型的就是先抽取孕妇的外周血,提取游离DNA,通过高通量测序技术分析每染色体片段,判断胎儿是否是21号三倍体。第二代无创产前诊断分析的是基因突变诊断。 最新这篇文章通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序(195×和270×单倍体基因组覆盖),探索 ...
目录 一、前沿概述 二、主要结果 重测序、组装与注释 泛基因组 SV特征 PAV与古多倍化,WGD事件 基因SV与基因融合 SV与大豆驯化 SV影响基因表达及其与性状关联 一、前沿概述 ...
宏基因组测序: 浓度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA两次需要量>=3ug 宏基因组测序需要提供什么样品要求? (1)提供环境微生物的基因组DNA或者扩增产物,OD值在1.8 ...
出处:bilibili 关联分析(Association):在交易数据、关系数据或其他信息载体中 ...
最近学习微生物宏基因组分箱(binning),按官方文档安装metaWRAP,踩了一堆坑,记录一下报错及解决方法: 1. metaWRAP安装 安装教程及下载地址:GitHub - bxlab/metaWRAP: MetaWRAP - a flexible pipeline ...
软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析。。MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具。 软件安装 进入官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm,下载安装 ...