原文:R绘图(7): 把散点图的点换成扇形

前几天分析了一批单细胞TCR的数据,需要画这样一个图: 行是不同的样本,列是不同的T细胞类型,每一个位置点的大小表示T细胞的数目多少,并且还需要根据T细胞所属的克隆型类型涂色。这个图用来描述TCR是我自己构思的,之前没有在文章中见过。好在画图工具是现成的,用的是余老师的scatterpie包。后台回复 即可获取本文的测试数据。 . 导入测试数据 看一下数据格式 原始数据框有 个肿瘤样本, 个T细胞 ...

2021-07-22 16:56 0 229 推荐指数:

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R绘图-散点图

散点图是将所有的数据以的形式展现在直角坐标系上,以显示变量之间的相互影响程度,的位置由变量的数值决定,每个对应一个 X 和 Y 轴坐标。 散点图可以使用 plot() 函数来绘制,语法格式如下: plot(x, y, type="p", main, xlab, ylab, xlim ...

Fri Aug 20 03:02:00 CST 2021 0 261
R绘图(3): 散点图添加文本注释

这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change)。单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清。 示例数据df1是转录组做差异表达后的部分 ...

Tue Mar 09 00:49:00 CST 2021 0 560
R绘图 第十篇:绘制散点图(高级)

散点图用于描述两个连续性变量间的关系,三个变量之间的关系可以通过3D图形或气泡来展示,多个变量之间的两两关系可以通过散点图矩阵来展示。 一,添加了最佳拟合曲线的散点图 使用基础函数plot(x,y)来绘制散点图,其中x和y是数值型向量,代表着图形中的(x,y) abline ...

Thu Dec 27 17:01:00 CST 2018 0 9178
R绘图 第五篇:绘制散点图(ggplot2)

ggplot2包中绘制图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对分箱的方法有两种: ...

Fri Aug 03 22:52:00 CST 2018 0 20560
使用lattice进行高级绘图-- lattice 包(核密度图、箱线图、散点图、3D散点图图、散点图矩阵)

使用lattice进行高级绘图-- lattice 包 lattice包提供了用于可视化单变量和多变量数据的一整套图形系统。许多用户转向使用lattice包是因为它能很容易地生成网格图形。 网格图形能够展示变量的分布或变量之间的关系,每幅图代表一个或多个变量的各个水平。 思考下面的问题:纽约 ...

Wed Aug 18 05:34:00 CST 2021 0 154
R绘图 第九篇:绘制散点图和气泡图(ggplot2)

绘制散点图(scatterplots)使用geom_point()函数,气泡图(bubblechart)也是一个散点图,只不过的大小由一个变量(size)来控制。散点图潜在的最大问题是过度绘图:当一个位置或相邻的位置上出现有多个,就可能把绘制在彼此之上, 这会严重扭曲散点图的视觉外观 ...

Mon Aug 13 20:53:00 CST 2018 0 8492
 
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