ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 数据分析流程
补充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程，虽然可以完成任务，但是数据量一多，批次多起来，就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程，那就要用起来，管理起来不是一般的轻松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安装比较麻烦，没有针对local的一键安装 ...
原文：Seq数据分析流程RNA
文章目录 RNA seq 数据分析流程 相关软件安装 下载数据 sra转fastq格式 数据质控 数据质控，过滤低质量reads，去接头 比对 首先下载参考基因组及注释文件，建立索引 比对 sam文件转bam 为bam文件建立索引 reads的比对情况统计 计数 counts 差异基因分析 RNA seq 数据分析流程 相关软件安装 可以安装 conda,在后续其他软件安装时非常好用。可自行百度进 ...
2021-07-06 18:14 0 216 推荐指数：
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