原文:医学影像预处理之标注

标注工具 标注工具推荐使用ITK SNAP,windows linux和MacOS平台都支持。 标注的读取 通过ITK SNAP加载数据和label文件,我们可以看到用不同颜色区分的标注,如下图: 图中有两个label,分别为Label 和Label ,对应图中红色和绿色部分。 下面我们用程序读取label文件,看看具体的数据结构是怎样的。 结果如下: 程序中我们首先通过itk读取图像,并转换为n ...

2021-07-03 19:29 0 411 推荐指数:

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医学影像预处理之裁减

背景 在数据集训练之前,为了减小数据计算的工作量,提高训练的速度,通常会针对感兴趣的特征部分进行原图片的裁减,这样每张图片既保留了待提取的特征集,又缩小了整体的尺寸,可有效缩短模型训练耗费的时间。 ...

Sat Jun 26 20:52:00 CST 2021 0 324
医学影像重采样

1. 重采样 在医学图像预处理的过程中,常常需要对数据进行重采样,采样到我们需要的尺度。因为医学图像是和真实空间的物理尺寸相对应的。例如一个体素的大小是0.97mm 0.97mm 2.5mm,我们想将体素块的大小采样到1mm 1mm 1mm,这样可以帮助我们进行下一步处理。利用 sitk ...

Mon Dec 09 03:28:00 CST 2019 0 682
C#开发PACS医学影像处理系统(七):读取影像Dicom信息

Dicom的文件信息一般是由设备信息、图像信息、病人信息等Tag标记组成的,用字节长度和偏移量来区分, 具体数据结构可以自行去参考Dicom文件解析,内容比较多,这里不赘述。 对于常用的Ta ...

Tue Sep 15 00:41:00 CST 2020 6 1819
C#开发PACS医学影像处理系统(六):加载Dicom影像

对于一款软件的扩展性和维护性来说,上层业务逻辑和UI表现一定要自己开发才有控制权,否则项目上线之后容易被掣肘, 而底层图像处理,我们不需要重复造轮子,这里推荐使用fo-dicom,同样基于Dicom3.0协议。 根据以上原则,后台影像处理完成之后,即可使用自己开发的控件来呈现。 1.先 ...

Tue Sep 15 00:40:00 CST 2020 7 3804
C#开发PACS医学影像处理系统(十一):Dicom影像挂片协议

通俗点说,挂片协议可以看作整个系统的一个相对复杂一点的配置文件,可以用JSON或XML格式来读取与保存, 另外,可以制作一个独立的exe配置程序来管理这些挂片协议。 假设配置了CT的挂片协议的右键菜单,那么在打开CT影像时则是对应的不同的动态的右键菜单,如下图 ...

Wed Sep 16 17:19:00 CST 2020 0 1216
 
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