ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 数据分析流程
，但我们可以借鉴Dockerfile文件里面的安装方法。 也可以模仿chip-seq-pipeline2 ...
原文：ChIP-seq流程结果文件解读
接前面文章：ChIP seq ATAC seq RNA seq 数据分析流程 前面已经把pipeline跑完了，但是关于结果的解读还是不清楚，这里来深入探讨一下。 复习： pipeline：https: github.com ENCODE DCC chip seq pipeline 大致流程图：https: www.encodeproject.org pipelines ENCPL XAE chi ...
2021-06-17 20:21 0 305 推荐指数：
相关推荐
ChIP-seq 数据分析1 ChIP-Seq技术2 ChIP-Seq数据分析
1 ChIP-Seq技术 1.1 概念 1.2 ChIP-seq技术原理 2 ChIP-Seq数据分析 2.1 数据下载 2.2 质量控制（data_assess） 2.3 比对到参考基因组 ...
homer进行motif分析 ChIP-seq
http://homer.salk.edu/homer/ 【怪毛匠子-整理】 使用HOMER分析CLIP-SEQ数据 24 5 2月 2013 | 程序员 Tags: 生物信息学 · 软件 HOMER是一个使用perl和C写成的motif分析工具。之前在分析clip-seq分析时 ...
ChIP-seq技术介绍｜易基因
大家好，这里是专注表观组学十余年，多组学科研服务领跑者的易基因。 染色质免疫沉淀后测序(ChIP seq)是一种针对DNA结合蛋白、组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。由于二代测序技术的巨大进步，ChIP-seq比其最初版本ChIP-chip具有更高的分辨率、更低的噪声和更大的覆盖范围 ...
表观遗传、开放染色质测序、ATAC-seq、ChIP-seq简介
表观遗传 表观遗传的3个机制：DNA甲基化；组蛋白修饰；chromatin remodeling 开放染色质测序： 参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/ ...
转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq
： 1. RNA-seq分析差异基因，间接推测调控的转录因子。 2. 基于大量的ChIP-seq公共数 ...
chip-seq数据分析中peak-calling软件-------MACS的安装
1.下载MACS软件安装包（作者的系统为Ubuntu） 网址链接：http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/ 2.解压文件： tar -zxvf MACS**.tar.gz 3.更改文件夹的名字（个人习惯） mv MACS1.1-4 MACS 4.进入到 ...
表观 | Enhancer | ChIP-seq | 转录因子 | 数据库专题
需要长期更新！ 参考：生信修炼手册 enhancer的基本概念： 长度几十到几千bp，作用是提高靶基因活性，属于顺式作用原件，DNA作用到DNA，转录因子就是反式，是结合到DNA的蛋白。 ...