参考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代测序 第二代高通量测序也称为下一代测序技术,相比于第一代测序通量更高、速度更快、成本更低,主要有样本制备、文库构建、测序反应等过程。 一、常用概念 泳池(flowcell):如图所示,测序反应 ...
参考: https: zhuanlan.zhihu.com p 一 目的 讲解二代测序如何从很短的reads拼接为一个完整的基因组 双端测序,如何对 paired end 进行拼接 二 单端测序 测序中最简单的办法,只有一种测序引物,使得PCR只能沿着这个引物的方向进行,所有的reads都只能按照一个方向进行读取。但是这带来了一些问题,以illumina为例,测序的质量会随着测序的进行而下降,所以 ...
2021-06-02 10:00 0 2744 推荐指数:
参考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代测序 第二代高通量测序也称为下一代测序技术,相比于第一代测序通量更高、速度更快、成本更低,主要有样本制备、文库构建、测序反应等过程。 一、常用概念 泳池(flowcell):如图所示,测序反应 ...
Roche 454,Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。在基因组De Novo测序过程中,Roche454的单端测序读长可以达到400p,经常用于基因组骨架的组装,而Solexa和ABI SOLID双端测序可以用于组装scaffolds和填补gap。下面以solexa ...
1、ORF:开放阅读框,开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。从起始密码子开始,到终止密码子结束。前面是5‘UTR, 后面是3’UTR,ORF ...
参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/340449764 Base calling是一种算法(软件):可以从row images(原始图像)里通过计算机视觉的方式识别碱基类型(DNA序列),将结果写到cal文件里,最后帮助我们生成测序报告和FastQ数据 ...
1、原理(马达蛋白 纳米孔蛋白 电阻膜) 1.1 马达蛋白牵引DNA/RNA 与纳米孔蛋白结合,因为薄膜两端电势差导致解链后的链可以通过纳米孔。而通纳米孔的碱基因为结构和带电的不同产生的电阻不同,导致电信号不同。最后通过basecalling的方法对原始的电信号解读获得碱基。 1.2 ...
直接上代码吧。 结果如下: 继承关系是:deque => queue => collection=》Iterable 1.使用队列的时候,new Link ...
ArrayDeque双端队列 使用&实现原理分析 学习Okhttp实现源码时,发现其任务分发时用到了ArrayDeque。因此了解一下ArrayDeque的使用方式和实现原理。 一、Deque deque(double-ended queue)双端队列,是一种具有队列和栈的性质 ...
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增 ...