详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法 ...
基本局部比对搜索工具 BLAST 可查找两个序列之间具有局部相似性的区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。BLAST 可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助识别基因家族的成员。 下载与安装 下载地址:https: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast executables blast LATEST 这里我下载的是 Linux 系统的下 ...
2021-05-31 10:12 0 1586 推荐指数:
详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法 ...
软件下载 BLAST+的一般用法如下: 格式化数据库 参数说明: -in:待格式化的序列文件 -dbtype:数据库类型,prot或nucl -out:数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库(blastp) 参数说明: -query: 输入文件路径及文件名 -out:输出文件路径 ...
一、软件配置 curl -O ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz tar zxvf ...
如何下载NCBI blast数据库? 有哪些可供下载的blast数据库? blast如何使用? blast构建索引 | makeblastdb ...
链接:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=830496&do=blog&quickforward=1&id=640600 Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST ...
简介 NCBI除了提供在线的Web BLAST序列比对服务外,还提供FTP方式下载序列比对工具。这允许在本地平台上针对从NCBI下载或本地创建的数据库执行BLAST搜索。这些实用程序没有图形用户界面,通过类似DOS的命令窗口运行,并通过基于文本的命令行开关接受输入 ...
WordPress安装详细教程 http://www.yzipi.com/3055.htm http://www.yzipi.com/13.htm ...
一、说明 Blast,全称Basic Local Alignment Search Tool,即"基于局部比对算法的搜索工具",由Altschul等人于1990年发布。Blast能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能,它能够快速的找到两段序列之间的同源序列并对比 ...