:拥有MET 14号外显子及其内含子侧翼突变的非小细胞肺癌患者可能对c-Met抑制剂有应答。本文中探索 ...
今天介绍的这一篇文献 Ref ,发表在NC上,中规中矩,分析内容很全面也很常见 话说,NC上面好多这种描述性的单细胞文章 。 下面我会简单介绍一下文献内容,涉及到以下内容,大家可能会感兴趣: 这篇文章是如何鉴定肿瘤细胞的 我之前专门写过一篇推文讲这个 肿瘤细胞和非肿瘤细胞一起降维聚类时,需不需要去批次 肿瘤细胞的异质性可以从哪几个角度说明 肿瘤细胞的拟时序 轨迹分析怎么做 monocle 的经典 ...
2021-05-29 11:35 0 228 推荐指数:
:拥有MET 14号外显子及其内含子侧翼突变的非小细胞肺癌患者可能对c-Met抑制剂有应答。本文中探索 ...
一、单细胞测序简介 单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。 我们经常看到的scRNA-seq ...
三、单细胞测序原理 今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台,所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。 (1)10X Genomics单细胞测序原理 上图是10X单细胞测序的原理图。首先要 ...
单细胞测序的知识 刘小泽 已关注 2018.07.20 21:33* 字数 1885 阅读 675评论 0喜欢 7 刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...
摘要 单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq, scRNA-seq)强调了细胞间 ...
相信做过肿瘤单细胞的小伙伴对这个分析并不陌生,如果多读几篇文献,就能在CNS以及大子刊上面看到这个分析。 非负矩阵分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法。 基本思想:给定一个非负矩阵V, NMF ...
cell type classify .caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px sol ...
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...