原文:文献(4): Nature子刊_晚期非小细胞肺癌的单细胞图谱

今天介绍的这一篇文献 Ref ,发表在NC上,中规中矩,分析内容很全面也很常见 话说,NC上面好多这种描述性的单细胞文章 。 下面我会简单介绍一下文献内容,涉及到以下内容,大家可能会感兴趣: 这篇文章是如何鉴定肿瘤细胞的 我之前专门写过一篇推文讲这个 肿瘤细胞和非肿瘤细胞一起降维聚类时,需不需要去批次 肿瘤细胞的异质性可以从哪几个角度说明 肿瘤细胞的拟时序 轨迹分析怎么做 monocle 的经典 ...

2021-05-29 11:35 0 228 推荐指数:

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单细胞测序学习(一)

一、单细胞测序简介   单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。   我们经常看到的scRNA-seq ...

Thu Oct 29 17:13:00 CST 2020 0 658
单细胞测序学习(二)

三、单细胞测序原理   今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台,所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。  (1)10X Genomics单细胞测序原理         上图是10X单细胞测序的原理图。首先要 ...

Thu Oct 29 17:19:00 CST 2020 0 1281
单细胞测序的知识

单细胞测序的知识 刘小泽 已关注 2018.07.20 21:33* 字数 1885 阅读 675评论 0喜欢 7 刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...

Sat Oct 20 04:02:00 CST 2018 0 1917
单细胞分析实录(16): 负矩阵分解(NMF)检测细胞异质性

相信做过肿瘤单细胞的小伙伴对这个分析并不陌生,如果多读几篇文献,就能在CNS以及大子上面看到这个分析。 负矩阵分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)是在矩阵中所有元素均为负数约束条件之下的矩阵分解方法。 基本思想:给定一个负矩阵V, NMF ...

Sat Jun 26 04:14:00 CST 2021 0 216
单细胞中的细胞类型划分

cell type classify .caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px sol ...

Fri Mar 15 04:13:00 CST 2019 0 814
Seurat | 单细胞分析工具

Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...

Mon Jun 04 19:09:00 CST 2018 0 2724
 
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