原文:使用FastqCount统计fastq文件基本信息?

目录 . FastqCount简介 . 使用 . 结果 . FastqCount简介 快速实用小工具:FastqCount https: github.com zhimenggan FastqCount 统计指标包括: Total Reads Total Bases N Bases Q Q GC . 使用 压缩文件可搭配pigz使用更香。 单个fastq .gz 文件: 多文件: . 结果 ...

2021-05-26 21:00 0 1015 推荐指数:

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统计 fastq 文件 q20 , GC 含量的软件

二代测序的分析过程中,经常需要统计原始下机数据的数据量,看数据量是否符合要求;另外还需要统计q20,q30,GC含量等反应测序质量的指标; 在kseq.h 的基础上稍加改造,就可以实现从fastq 文件统计这些指标的功能,而且速度非常的快 源代码保存为 parse.c ...

Tue Feb 14 22:56:00 CST 2017 6 2483
Postgresql统计所有表的基本信息(如行数、大小等)

目录 pg_class 记录表和几乎所有具有列或者像表的东西。这包括索引(但还要参见 pg_index )、序列、视图、物化视图、组合类型和TOAST表,参见 relkind 。下面,当我们提及所有这些类型的对象时我们使用“关系”。并非所有列对于所有关系类型都有 ...

Thu Sep 03 01:37:00 CST 2020 0 1434
sqlmap基本信息及参数使用方法

当给sqlmap这么一个url的时候,它会: 1、判断可注入的参数 2、判断可以用那种SQL注入技术来注入 3、识别出哪种数据库 4、根据用户选择,读取哪些数据 sqlmap支持五种不同的注 ...

Thu Jul 25 23:55:00 CST 2019 0 724
文件格式——fastq格式

fastQ格式 FASTQ是一种存储了生物序列(通常是核酸序列)以及相应的质量评价的文本格式. 他们都是以ASCII编码的。现在几乎是高通量测序的标准格式。NCBI Short Read Archive也是这格式,多了一些描述性词汇而已。 基本格式 包含四行,第一行由'@'开始,后面 ...

Wed May 03 19:36:00 CST 2017 0 1266
租户的基本信息

CREATE TABLE `t_tenant` ( `tenant_id` varchar(40) NOT NULL DEFAULT 'c12dee54f652452b88142a0267ec74b7 ...

Thu Mar 05 23:20:00 CST 2020 1 673
Web Workers 的基本信息

问题:JavaScript 并行性 要将有趣的应用(例如从侧重服务器端的实施)移植到客户端 JavaScript,存在很多制约瓶颈。其中包括浏览器兼容性、静态类型、可访问性和性能。幸运的是,随着浏览 ...

Fri Feb 07 18:13:00 CST 2014 2 2518
 
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