GWAS分析基本流程及分析思路
数据预处理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的工作用IMPUTE2完成 2. 表型数据统计分析 ...
原文：GWAS分析结果中pvalue/p.ajust为0时如何处理？
在GWAS分析的结果中，偶尔会遇到到pvalue为 的SNP位点，这时如果直接做曼哈顿或QQ图，会出错，因为log 无意义。 此时，该如何处理 如果你用的是Plink . 来做的GWAS，可加一个参数： output min p e ，即将小于 e 的pvalue都当成 e ， 也不例外。 如果你用的是其他软件，手动将结果改动。可先用NA填充，再以最小值或更小值替换，如： 为何会出现pvalue为 ...
2021-05-04 21:43 0 976 推荐指数：
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