原文:如何解压从UK biobank下载下来的tsv.bgz文件?

今天碰到一个问题,就是从UK biobank下载下来的gwas result file是filename.tsv.bgz格式。这东西需要解压才能阅历,可是用zip或者rar都是搞不定,网上搜了一圈,说用zcat解压,可是找不到zcat。于是就上Google上面搜了一圈,尝试了用R语言的R.utils包解压读取数据,但是数据太大,电脑动不了。最后发一下比较可行的办法,就是用linux系统。 第一步 ...

2021-04-22 23:34 0 303 推荐指数:

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UK Biobank专题

这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing ...

Sat May 11 22:42:00 CST 2019 0 1337
何解压deb文件

有两种方法: Bash代码 1、dpkg -x xx.deb /tmp/oo 注意:/tmp/oo为自己解压文件路径,可以随意指定路径 2、ar -vx xx.deb 这会解压出3个文件debian-binary,control.tar.gz,data.tar.gz 然后再:tar ...

Mon Aug 20 01:47:00 CST 2018 0 1556
何解压rar文件

安装 使用: 1、rar命令 2、unrar命令 tks ...

Wed Feb 16 08:32:00 CST 2022 0 1359
何解压.7z文件

sudo apt-get install p7zip-full 7z x manager.7z -r -o/home/xx 解释如下: x 代表解压缩文件,并且是按原始目录解压(还有个参数 e 也是解压缩文件,但其会将所有文件解压到根下,而不是自己原有的文件夹下)manager.7z 是压缩文件 ...

Wed Oct 25 06:58:00 CST 2017 0 1518
Pandas读取tsv文件

TSV文件和CSV的文件的区别是:前者使用\t作为分隔符,后者使用,作为分隔符。 使用pandas读取tsv文件的代码如下: train=pd.read_csv('test.tsv', sep='\t') 1 如果已有表头,则可使用header参数: train ...

Fri Jul 20 05:04:00 CST 2018 0 2727
python读取tsv文件

import scipy as sp data = sp.genfromtxt("filename.tsv", delimiter="\t") ...

Wed Jul 03 18:00:00 CST 2019 0 2854
tar.xz文件何解压

XZ压缩 xz压缩文件方法或命令 xz -z 要压缩的文件 如果要保留被压缩的文件加上参数 -k ,如果要设置压缩率加入参数 -0 到 -9调节压缩率。如果不设置,默认压缩等级是6. xz解压文件方法或命令 xz -d 要解压文件 同样使用 -k 参数来保留被解压缩的文件 ...

Fri Sep 07 19:40:00 CST 2018 0 41821
 
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