基因组注释
基因组注释主要包括四个研究方向：重复序列的识别；非编码RNA的预测；基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义：重复序列可分为串联重复序列（Tendam repeat）和散在重复序列 ...
原文：【基因组注释】GMAP安装使用问题
homology策略预测基因结构，下载了公共mRNA CDS序列，考虑用gmap比对。本来是个很简单的脚本，但总是不那么顺利。 无论是用conda安装，还是源码安装较新版本，都存在问题。 第一步建立索引都没问题。但比对时，没报错，出现如下： 结果是cds gene.gff 除了表头，一条结果都没有。 在网上找了一圈，推荐版本降级，参考：https: github.com PASApipeline ...
2021-04-15 22:43 0 336 推荐指数：
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