genome repeat sequence | 基因组重复序列
基因组里的小写字母的序列就是soft masking，也就是被标记的重复序列。 怎么把重复序列提取出来，保存为bed文件？ 参考：Uppercase vs lowercase letters in reference genome ...
原文：如何识别自己基因组数据是哪个全基因组参考版本（Genome Reference Versions/ Genome Build）
首先在这里先感谢我们 Bio生信学习交流群 的群友和创建此群的群主 陈博士后 。 今天解决的问题是怎么查看自己的基因组数据是哪个Genome Reference Versions。 步骤： 第一步，打开你的基因组数据bim文件 Plink格式 ，随便找一个SNP，如下图。 第二步，复制选中位点的rs编号 上图黄色框内容 ，然后打开NCBI网站，选中SNP选项，将位点的rs编号黏贴进去，点即查询。 ...
2021-04-07 20:14 0 319 推荐指数：
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