原文:用网络图展示富集分析

这期推文的封面是一张富集分析的网络图,来自文献:Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations,算是比较新颖的富集展示方法,是用Cytoscape做的。 之前我介绍过一个网页工具,可以做富集结果的网络图,这篇推文的阅读量已经是我的小破公众号关注人数的两倍多, ...

2021-04-02 00:23 0 412 推荐指数:

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excel之富集分析制作

excel之富集分析制作 最终效果: 原始数据: 步骤: 1.数据处理 1.1 将PV数据分组,用来创建不同颜色的柱状图例 数据处理结果:(每类数据一列。将该列其他数据删除后将不显示在图标上。) 1.2创建辅助列,用于充当折线图的x轴,将折线图改为纵向 ...

Wed Dec 01 03:43:00 CST 2021 0 836
Pathway富集分析气泡

data.tsv > pathway = read.table("data.tsv",header = T, sep="\t") > library(ggplot2) ...

Tue Sep 19 00:07:00 CST 2017 0 5458
什么是网络图(Project)

《Project2016 企业项目管理实践》张会斌 董方好 编著 名词解释:网络图…… 咦?书里没写? 看来张同学也不喜欢名词解释(猜的)哈哈哈…… 但是! 人家写了两种网络图:双代号网络图和单代号网络图。 双代号传说应用已逐渐减少,那就无视之吧。 “单代号网络图:这是 ...

Sun Jul 12 00:23:00 CST 2020 0 1150
网络图

一.结点网络图 二.箭线网络图(常用,有虚线) 结构 虚线只是为了美感,有没有不会扣分 实线是事件和活动 一个网络图只能有一个终点,如果有两个终点也要用虚线处理成一个终点 关键线路是天数最大的天数(总时间最长),如下1379就是关键线路 ...

Fri Mar 25 05:39:00 CST 2022 0 732
Python生成gexf文件并导入gephi做网络图分析

Gephi是一款优秀的复杂网络分析软件,支持导入多种格式的文件。gexf格式是Gephi 推荐的格式,基于 XML。本文是一个用python写的简单Demo,示例如何生成一个典型的gexf格式文件。代码基于pygexf包(下载地址:https://github.com/paulgirard ...

Tue Aug 25 00:30:00 CST 2015 0 13870
进度网络图绘图规则

目录 一、双代号网络图 1.表示方法 2.要求 3.绘图规则 一、双代号网络图 1.表示方法 1、箭线:在双代号网络中,工作一般使用箭线表示,任意一条箭线都需要占用时间,消耗资源,工作名称写在箭线的上方,而消耗的时间 ...

Sat Jan 30 01:42:00 CST 2021 0 401
使用Cytoscape画PPI网络图

打开Cytoscape软件,根据菜单导入string_interactions.tsv文件 File ----> Import ----> Network from File 会弹出下 ...

Thu Apr 04 07:10:00 CST 2019 0 2758
 
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