From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增 ...
什么是CNV copy number variation CNV A copy number variation CNV is when the number of copies of a particular gene varies from one individual to the next. Following the completion of the Human Genome Proj ...
2021-05-07 14:49 0 210 推荐指数:
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增 ...
本,这些转录本分别在细胞/个体分化发育的不同阶段,在不同的组织中有各自特异的表达和功能,从而极大地丰富了编码R ...
自从2009年单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展 ...
实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...
单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...
本次分享一篇今年2月才发表于Nature Methods的基于单细胞转录组数据推断基因调控网络的方法比较的文章,“Benchmarking algorithms for gene regulatory network inference from single-cell ...
之前写过三篇和CNV相关的帖子,如果你做肿瘤单细胞转录组,大概率看过: 单细胞分析实录(11): inferCNV的基本用法 单细胞分析实录(12): 如何推断肿瘤细胞 单细胞分析实录(13): inferCNV结合UPhyloplot2分析肿瘤进化 其中,第三篇帖子里面有两个注释代码 ...
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...