上位置为122-124范围的位点 cat variants.vcf | java -jar Sn ...
目录 需求 示例文件 代码实现 补充说明 需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实现 run.sh 运行sh run.sh gene.txt test.vcf,或sh run.sh gene.txt test.vcf.gz 生成结果: 补充说明 以上代码中利用了vcftools工具 ...
2021-03-13 23:04 0 1430 推荐指数:
上位置为122-124范围的位点 cat variants.vcf | java -jar Sn ...
做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎。这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools-1.5 一、根据个体提取子集 根据样品名提取vcf文件,准备要保留的个体名文件 ...
SNP是单核苷酸多态性,人的基因是相似的,有些位点上存在差异,这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性,它影响着生物的性状,影响着对某些疾病的易感性。SNPedia是一个SNP调査百科,它引用各种已经发布的文章,或者数据库信息对SNP位点进行描述,共享着人类基因组变异的信息。我们可以搜索 ...
最近采集了15万张图片,每天采集的图片存储在一个新的目录下,在测试时需要从所有文件夹中随机抽取图片做测试。 ...
问题背景 假设我们有以下的测试程序: 这就是说,要我们实现一个给 string 类扩展一个 RemoveCharOf 方法,用以移除指定字符串所有出现在 chars 参数中的字符。这个扩展方法除了上例中用于获得一个合法的文件名外,还可以有其他的用途。比如我最近一个项目中要把给定 ...
meQTL.pl matrix_meQTL.r readme.txt plot_boxplot.r ...
压缩软件呢!但这个压缩软件的强大之处在于,专门压缩WORD和POWERPOINT文件,压缩率高到吓死人,最 ...
虽然说最近,有的提案其实2010年就存在了。基本上是firefox, webkit在推动。主要如下: calc: css3的函数,现在只有opera不支持。只要用于混合单位的计算,不能你手动转换。这 ...