原文:R绘图(3): 散点图添加文本注释

这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p value,横轴表示log fold change 。单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清。 示例数据df 是转录组做差异表达后的部分结果,df 将logFC绝对值大于 . 的挑出来了。 先看一下,没加文本的图 接下来用ggplot 里面 ...

2021-03-08 16:49 0 560 推荐指数:

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R绘图-散点图

散点图是将所有的数据以点的形式展现在直角坐标系上,以显示变量之间的相互影响程度,点的位置由变量的数值决定,每个点对应一个 X 和 Y 轴点坐标。 散点图可以使用 plot() 函数来绘制,语法格式如下: plot(x, y, type="p", main, xlab, ylab, xlim ...

Fri Aug 20 03:02:00 CST 2021 0 261
R绘图(4): 散点图添加相关系数/回归方程

属于比较常用的技巧。下面我用ggplot2内置数据集进行演示: 先来看一下,仅有散点和拟合线的图 如果想添加拟合的方程,可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()函数,该函数可以拟合多项式方程并生成多种标签,比如p值、决定系数R方,这些由函数计算出来的量通常名称 ...

Mon Mar 15 04:13:00 CST 2021 0 715
R绘图(7): 把散点图的点换成扇形

前几天分析了一批单细胞TCR的数据,需要画这样一个图: 行是不同的样本,列是不同的T细胞类型,每一个位置点的大小表示T细胞的数目多少,并且还需要根据T细胞所属的克隆型类型涂色。这个图用来描述TC ...

Fri Jul 23 00:56:00 CST 2021 0 229
R绘图 第十篇:绘制散点图(高级)

散点图用于描述两个连续性变量间的关系,三个变量之间的关系可以通过3D图形或气泡来展示,多个变量之间的两两关系可以通过散点图矩阵来展示。 一,添加了最佳拟合曲线的散点图 使用基础函数plot(x,y)来绘制散点图,其中x和y是数值型向量,代表着图形中的点(x,y) abline ...

Thu Dec 27 17:01:00 CST 2018 0 9178
R绘图 第五篇:绘制散点图(ggplot2)

ggplot2包中绘制点图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变点的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对点分箱的方法有两种:点 ...

Fri Aug 03 22:52:00 CST 2018 0 20560
R语言添加注释

使用#,添加注释 x=c(1,2,3) #zhang ...

Thu Feb 16 01:27:00 CST 2017 0 1598
 
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