原文:R语言——pheatmap包

载入包 载入数据 绘制热图 生成行列注释 ...

2021-03-06 21:23 0 305 推荐指数:

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R语言 绘制热图 pheatmap

pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...

Tue Jun 15 01:10:00 CST 2021 0 1694
Rpheatmap:用参数一步步详细绘制热图

经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用Rpheatmap一步步绘制热图。 第一步:公众路径设置,调用pheatmap,读取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入绘制热图(图1-图15) 一建热图(图1) p<-pheatmap(data ...

Sun Jun 07 05:04:00 CST 2020 0 4793
r语言 说明

【在实际工作中,每个数据科学项目各不相同,但基本都遵循一定的通用流程。具体如下】 【下面列出每个步骤最有用的一些R】1.数据导入以下R主要用于数据导入和保存数据:feather:一种快速 ...

Thu Dec 22 01:23:00 CST 2016 0 2161
[R] 保存pheatmap图片对象到文件

一般我们使用pheatmap通过Rstudio交互得到的图片在plots的Export导出即可,如何保存对象到文件呢?这个需求在自动化流程中很常见,作者似乎也没说明。 生成示例数据: 看下数据亚子: 实现方法 接下来实现方法,分为两步: 1.保存对象 2. 打开图形设备重新画 ...

Fri Aug 16 07:35:00 CST 2019 0 643
R语言包翻译

Shiny-cheatsheet 作者:周彦通 1.安装 install.packages("shinydashboard") 2.基础知识 仪表盘有三个部分:标题、侧边栏,身体。下面是最最小的仪表面板页面的UI: # ui.R #library ...

Wed May 31 04:21:00 CST 2017 7 1001
R语言包的安装

pheatmap的安装 1: 首先R语言的安装路径里面最好不要有中文路径 2: 在安装其他依存的scales和colorspace时候要关闭防火墙 错误提示: 试开URL’https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin ...

Thu Feb 15 18:14:00 CST 2018 0 1314
R语言常用汇总

/thread-116761-1-1.html 时间上有点过期,下面的资料供大家参考 基本的R已经实现了传统多元统计的很多功能,然 ...

Mon Oct 15 07:14:00 CST 2018 0 8523
R语言 ggplot2

R语言 ggplot2的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它。对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离 ...

Thu Apr 13 18:07:00 CST 2017 0 7040
 
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