原文:genome browser | ggplot | 基因组可视化 | R | transcript | isoform

年 月 日 更新 给每个exon编排序号,方便管理 cat gencode.v .annotation.gtf grep ENSG cut f grep exon sort k uniq less S 更新:又用了一段时间,发现是真的好用,可惜就是服务器上装不上,只能在Mac上用了。 核心代码很少: library ggbio hg library EnsDb.Hsapiens.v ensdb ...

2021-03-05 17:57 0 301 推荐指数:

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R语言可视化--ggplot函数

上一篇说了qplot函数,现在说一下ggplot函数 本身不能实现,需要添加层才可以。ggplot2的核心函数 ...

Wed Jul 19 21:07:00 CST 2017 0 14178
genome repeat sequence | 基因组重复序列

基因组里的小写字母的序列就是soft masking,也就是被标记的重复序列。 怎么把重复序列提取出来,保存为bed文件? 参考:Uppercase vs lowercase letters in reference genome ...

Mon Mar 26 08:00:00 CST 2018 0 935
R:ggplot2数据可视化——进阶(1)

,分为三个部分,此篇为Part1,推荐学习一些基础知识后阅读~ Part 1: Introduction to ggplot2, 覆盖构建简单图表并进行修饰的基础知识 Part 2: Customizing the Look and Feel, 更高级的自定义图形 ...

Tue Sep 10 00:48:00 CST 2019 0 352
R:ggplot2数据可视化——基础知识

1 安装 # 获取ggplot2 最容易的就是下载整个tidyverse: install.packages("tidyverse") # 也可以选择只下载ggplot2: install.packages("ggplot2") # 或者下载GitHub上的开发者版本 ...

Mon Sep 09 09:40:00 CST 2019 0 2151
 
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