以Ezh2为例,彻底搞明白一个调控因子regulator的调控原理。 这个是一个非常典型的调控因子,广泛涉及了epigenome, regulatome and transcriptome,这里还会加入miRNA,一旦把这个搞清楚了将会受益无穷。 Polycomb-group ...
前篇:EZH Ezh 组蛋白甲基化酶 组蛋白甲基转移酶 关键调控因子 类似Ezh ,都是比较火爆的核心调控因子,与多种疾病和通路有关,可以搜到很多文章都围绕它来讲故事。 目的:鉴定出HDAC 激活和抑制的靶基因。 老套路: HDAC 上调,则其激活的target genes必然也会上调 既然是TF,那在promoter肯定有motif enrichment HDAC 上调,则其抑制的target ...
2021-03-17 20:46 0 302 推荐指数:
以Ezh2为例,彻底搞明白一个调控因子regulator的调控原理。 这个是一个非常典型的调控因子,广泛涉及了epigenome, regulatome and transcriptome,这里还会加入miRNA,一旦把这个搞清楚了将会受益无穷。 Polycomb-group ...
类似之前的EZH2和HDAC1,但更复杂一点。 一些缩写: RNA-binding proteins (RBPs)RNA-binding domains (RBDs) RNA recognition motif (RRM) hnRNP K-homology (KH ...
1. 组蛋白 “核小体”是染色体的基本结构单位。4种组蛋白,各2个组成一个8聚体,DNA链再 缠绕上去,就形成核小体了。每个组蛋白肽链都有氮端和碳端两个“尾巴”,这些“尾巴”上的氨基酸可以被加上一些化学基团,即“修饰”。 2. 有哪些修饰?按照化学基团 ...
下表为常见的组蛋白修饰的主要分布及功能: 异染色质是染色质的浓缩,转录无活性状态,H3K9甲基化是异染色质的标志。H3K27me1和H3K9me3存在于着丝粒异染色质区域 ...
参考资料: 1.医学分子生物学 第六章 第一节 表观遗传学-甲基化 2.医学分子生物学 第六章 第二节 表观遗传学-组蛋白修饰 3.组蛋白修饰是个啥 1.什么是表观遗传学? 举个例子:同卵双生的双胞胎个体,从遗传学角度说他们的DNA序列是一致的,但多种表型存在一些差异。经典的孟德尔遗传定律 ...
类似篇:转录因子motif TSS区域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一个新的领域,现在我关注的是可变剪切调控因子,如PTBP1,它们有特定的RNA结合motif,类似TF。 相同点: 都是蛋白质的序列结合区域 ...
近年来,组蛋白翻译后修饰(PTMs)因其能够通过改变染色质结构进而调控基因转录和表达,在恶性转化、肿瘤发生和进展中发挥重要作用 [1 ],已成为表观遗传研究热点之一。目前发表的研究报道已鉴定到乳酸化、苯甲酰化、巴豆酰化等多种组蛋白翻译后修饰类型,并对其开展了深入研究,极大的拓展了我们对表观遗传学 ...
针对特定应用,开发人员可通过调制扩频因子、调制带宽、纠错编码率这三个关键设计参数,对LoRa调制解调技术进行优化。 1、扩频因子(SF) LoRa采用多个信息码片来代表有效负载信息的每个位,扩频信息的发送速度称为符号速率(Rs),而码片速率与标称的Rs比值即为扩频因子(SF ...