高通量测序数据分析: 高通量测序中,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么关系? 1. 什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代 ...
.什么是Reads 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 .什么是Contig 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig 重叠群 。 .什么是Scaffold 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建 Paired end库或Illumina Mate pair库,以获得一定大小片段 如 Kb Kb Kb Kb 两 ...
2021-02-20 10:23 0 277 推荐指数:
高通量测序数据分析: 高通量测序中,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么关系? 1. 什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代 ...
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往 ...
是接头,分为pcr扩增接头和测序接头,分别用于文库构建和测序的引物。index是索引序列,为区分不同样本 ...
测序总结,高通量测序名词 主要来自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准:一代测序了,故称之为黄金测序。 高通量测序最近这几年很火越来越火,但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆 ...
NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换 ...
可以发现几个规律: 14年之前的公司主营业务都是科技服务 14年之后成立的公司几乎没有奔着科技服务去的,行业开始分化,主要是做基因检测、个人基因组、液体活检; ...
本篇文章,主要参考了阳光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己测序的分析结果作为对比,加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http ...
【转】https://segmentfault.com/a/1190000011184076 整理一下React中关于state和props的知识点。 在任何应用中,数据都是必不可少的。我们需要直接的改变页面上一块的区域来使得视图的刷新,或者间接地改变其他地方的数据。React的数据 ...