原文:高通量测序中,read、contig和Scaffold分别是什么

.什么是Reads 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 .什么是Contig 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig 重叠群 。 .什么是Scaffold 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建 Paired end库或Illumina Mate pair库,以获得一定大小片段 如 Kb Kb Kb Kb 两 ...

2021-02-20 10:23 0 277 推荐指数:

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高通量测序的reads、contigscaffold什么意思?

高通量测序数据分析: 高通量测序,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么关系? 1. 什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代 ...

Sun Oct 11 05:24:00 CST 2020 0 2768
readcontigScaffold分别是什么

1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往 ...

Fri Sep 06 18:36:00 CST 2019 0 336
高通量测序基本知识

是接头,分为pcr扩增接头和测序接头,分别用于文库构建和测序的引物。index是索引序列,为区分不同样本 ...

Mon Mar 06 18:09:00 CST 2017 0 4661
测序总结,高通量测序名词

测序总结,高通量测序名词 主要来自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准:一代测序了,故称之为黄金测序高通量测序最近这几年很火越来越火,但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆 ...

Tue Oct 16 05:32:00 CST 2018 0 1199
NGS基础 - 高通量测序原理

NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换 ...

Sat Oct 20 02:28:00 CST 2018 0 2435
国内高通量基因测序公司成立 时间表

可以发现几个规律: 14年之前的公司主营业务都是科技服务 14年之后成立的公司几乎没有奔着科技服务去的,行业开始分化,主要是做基因检测、个人基因组、液体活检; ...

Sat Jan 19 23:31:00 CST 2019 0 733
用FastQC检查高通量测序原始数据的质量

本篇文章,主要参考了阳光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己测序的分析结果作为对比,加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http ...

Sun Dec 27 04:09:00 CST 2015 0 6985
Reactstate和props分别是什么

【转】https://segmentfault.com/a/1190000011184076 整理一下React关于state和props的知识点。 在任何应用,数据都是必不可少的。我们需要直接的改变页面上一块的区域来使得视图的刷新,或者间接地改变其他地方的数据。React的数据 ...

Tue Apr 24 19:25:00 CST 2018 0 2450
 
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