原文:【百奥云GS专栏】全基因组选择之工具篇

目录 . 免费开源包 库 . R包 . Python库 . 成熟软件 . WEB GUI工具 前面我们已经介绍了基因组选择的各类模型,今天主要来了解一下做GS有哪些可用的软件和工具。基因组选择处在热门研究阶段,每年都有不少新工具开发出来,可分析的软件非常之多,为了便于大家更加清晰地了解,这里我将它们分为免费开源包 库 成熟软件 WEB GUI工具三类,用户使用难度依次降低。 . 免费开源包 库 ...

2021-02-10 15:44 0 480 推荐指数:

查看详情

GS专栏】1-基因组选择介绍

目录 什么是基因组选择基因组选择技术的发展 基因组选择的原理和流程 基因组选择的模型 基因组选择的展望 参考资料 什么是基因组选择基因组选择(Genomic Selection,简称GS)这一概念由挪威生命科学大学的Theo ...

Wed Dec 30 20:04:00 CST 2020 0 792
GS模型】基因组选择之rrBLUP

目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP包简介 2.2 实操 3. 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接 ...

Thu Dec 10 01:01:00 CST 2020 0 948
基因组选择育种(GS)简介

基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...

Wed May 13 23:46:00 CST 2020 0 8069
GS文献】基因组选择技术在农业动物育种中的应用

中国农业大学等多家单位2017年合作发表在《遗传》杂志上的综述,笔记之。 作者中还有李宁院士,不胜唏嘘。 1.概述 GS的两大难题:基因组分型的成本,基因组育种值(genomic estimted breeding value, GEBV)的准确性。 基于个体的基因组估计育种值 ...

Wed Dec 16 01:21:00 CST 2020 0 571
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM