---恢复内容开始--- 我们经常说幻想着使用已有数据发表高分文章,的确,这样的童话故事每天都在发生,但如何走出第一步我们很多小伙伴不清楚,那么我们就从水稻SNP数据库的使用来讲起。 这是3k的水稻变异库,上面保存着现成的SNP,由于数据过大,网站的维护方使用 ...
目录 前言 四个SNP集 hapmapSNPs tagSNPs fixedSNPs barcodeSNPs hapmapSNPs的指标统计 tagSNPs的群体结构验证 tagSNPs的遗传多样性 tagSNPs用于GS fixedSNPs验证 barcodeSNPs指纹图谱 barcodeIndel SR R数据库 前言 王向峰老师 年发表在 Genomics Proteomics Bioin ...
2021-02-06 17:12 0 439 推荐指数:
---恢复内容开始--- 我们经常说幻想着使用已有数据发表高分文章,的确,这样的童话故事每天都在发生,但如何走出第一步我们很多小伙伴不清楚,那么我们就从水稻SNP数据库的使用来讲起。 这是3k的水稻变异库,上面保存着现成的SNP,由于数据过大,网站的维护方使用 ...
#从data0数据中筛选出属于2018年的变量 library(sqldf)data_2018<- sqldf("select* from data0 where year='2018年'") #从data0数据中筛选出属于2018年的变量 data_2018=subset ...
众所周知,全基因组关联分析(GWAS)发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点1)要么调控基因表达(eQTL); 2)要么影响增强子活性; 3)要么影响转录因子(TF)结合特异性; 4)要么啥也不 ...
本文背景知识 本章只涉及通过"数据库部署工具"部署KES V8R6集群,想要了解集群更多信息,请查看官方文档 安装前的准备 一,使用环境 节点规划 IP 说明 操作系统 192.168.40.111 ...
/DataSlicer 假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据,“6”表示 ...
首先,进入千人基因组数据库的网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/ 如下图所示,在数据库的框框里输入我们感兴趣的SNP,比如rs608139 搜索后出现如下界面,黄色区域是我们感兴趣的SNP,红色框框 ...
1.了解read.table 可以从带分隔符的文本文件导入数据,可以读入csv,txt等格式文件,并将其保存成数据框 read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'", dec = ".", numerals ...